Básicamente te afecta para cuando entres en evaluación para un ascenso mediante sistema de clasificación (ascenso a brigada, subtte, comandante, tcol..), y contarían los ultimos años.
Como bien han dicho, en la amplia mayoría va por pura antigüedad y solo en pocos casos se permite una nota inusualmente alta, especialmente tras la última directiva, ya lo que se hacía antaño de: Te presentas a suboficiales/oficiales? Venga te pongo nota mas alta" ya se acabó.